1032. Antso III.a Nagusia Nafarroako erregeak Iruñeko elizbarrutiaren zaharberritzeari buruzko pribilegioa ematen du, non Aralarko santutegia dokumentu bidez lehen aldiz aipatzen den Zamarceko Andre Mariaren mendeko eliza bezala, Barranka zeharkatzen zuen Done Jakueren antzinako ibilbidearen puntuetako bat. Hasierako santutegia -tenplu karolingioa- IX. mendekoa dela dirudi, eta arabiar eraso batean suntsitua izango zatekeen, beharbada 924an.
1040. Nafarroako errege García Sánchez de Nájera eta bere emazte Estefanía santutegiari dohaintza bat egiten diote “Santa Maria beti Ama Birjina eta santu, santu, apostolu, martiri, konfesore eta birjinen gurtzarako”. Aguinarteko monasterioa eta Muztillano eta Berroeta hiribilduak dohaintzan ematen dituzte. Antso Ramirez erregeak (1076-1094) aurreko dohaintzak berretsi zituen eta Allazozábal izeneko Arakilen monasterio bat eman zion santutegiari.
1074. Data hau, autore ezberdinek, tenplu erromaniko berriaren sagaratzea bezala hartzen dute, gaur egungo tenpluaren burualdea dena eta hiru nabez osatua dagoena. Peñalengo Antso IV.a erregeak, lehenago Aralarko mendietan eta beste toki batzuetan hamabost sarada eman zituena, data honetan santutegiari, Zamarceren menpekoa oraindik, bere jabetza guztiak berresten dizkio, “Bere sagaratzearen egunean”. D. Ramiro, Nafarroako errege infantea, García de Najeraren bigarren semea eta Sancho de Peñalenen anaia, gerran erabiltzen da Lur Santuan eta Jerusalemen konkistan parte hartzen du 1099an. Ekarri Nafarrora Kristoren Gurutzeko beso bat. Aralarrera joan eta han Lignum Crucis delakoaren zati bat utzi du, baita bikariotza, errenta eta hamarrenak ere. Gurutzea zenbait mendez mantentzen da sagrarioan, zilarrez apaindua, bolizko kaxa baten barruan, eta 1756an San Migelen irudian integratzen da.
1087. Sancho Ramirez erregeak eta haren seme Pedro Sanchezek hainbat ondasun aitortzen dizkiote Iruñeko gotzainari, besteak beste, Zamarceko monasterioa eta San Migel del Monte Excelso eliza eta San Migel de Excelsis hiribilduak. XI. mendearen amaieran, Antso Ramirez errege zela eta Pedro de Roda Iruñeko gotzaina zela, Garcia de Arnalt de Goñi zalduna etxetik kanpo geratu zen eta San Migel gurtzen aritu zen ermitau gisa. Jasotako limosnekin, tenplua altxatzen du, “Mirarien liburuan” jasotzen denez.
1098. Autore batzuek, elizaren sagaratzea bezala hartzen duten data, honen zeremonian, zazpi gotzainek parte hartu zutelarik. Tomas Burguikoak, Pedro Sanchez erregearen estatuetakoak izango liratekeela suposatzen du: Iruñea, Jaca, Bordele, Calahorra, Naiara, Huesca, Santiago, edo agian Marseilla eta Arlesekoak. Zeremonia irailaren hasieran izan zela suposatzen da, izan ere, hilabete honetako lehen igandean, duela gutxi arte, dedikazioaren jaia ospatzen zen.
1099. Pedro Sanchez, Nafarroako eta Aragoiko erregeak, santutegiarekin duen eskuzabaltasuna erakusten du, bere sendatze miraritsuaren ondoren. Esteban de Garibay y Zamalloak bere “Compendio” lanean dioenez, “Oinez igo zuen zerra hau, aldapan gora, hondarrez kargatutako alforja batzuekin, santutegiko obraren fabrikarako, eta mirakuluz sendatu zuen gau batez eliza honetan nolabaiteko gaixotasun sendaezina, naturaren arabera, eta printze zerutiarraren mesedea sentitu zuen”. 1099ko otsailean, Jainkoari eta San Migeli, Murguintoren tokia ematen die, eta, 1103an, Arguindoaingo hiribildua (Arakil) eta bere lurraldean zeuden bi monasterio, Santo Thomás de Mendibezua eta Izaga.
1125. Alfontso Batailatzaileak San Migelen zigorkadak errege zortasunetik salbuesten ditu santutegira bakarrik zerbitza zitzaten.
1130. Alonso Sanchez Nafarroako erregeak Tuterako eta Moncayotik gertu dagoen eta Gallurretik Cadreitaraino dagoen jabetzak ematen dizkio santutegiari.
1141. Tenpluaren egungo egituraren sagaratzearen urte posiblea: hiru ataleko hiru nabe eta nartex. Garcia Ramirez Nafarroako erregeak dohaintzak egiten dizkio santutegiari “San Migelen alde, eliza honen dedikazioan”. Data horretatik aurrera komunitate monastikoa ezartzen da.
1167. Santutegiaren hegoaldean atxikitako eraikina egingo dute, geroago izango dena, San Migel kofradiaren egoitza.
1175. Urte honetan, esmaltezko erretaula edo aurrealdea eraikitzen da, dirudienez, santutegia bereizteko Antso VI.a Jakituna erregeak eta Pedro Parisko gotzainak egindako enkargu baten ondorio dena. Egileak Limogesetik etorritako urregile eta esmaltatzaile talde bat izango lirateke, eta Nafarroan egin zuten beren obra.
1229. Pedro Ramirez de Piérola Iruñeko gotzainak San Migel Kofradiaren estatutuak onartzen ditu. Kofradiari bere etxea ematen dio, elizari erantsita, Iruñeko gotzaina bertako buru eta errektore izateko baldintzapean.
1368. Bernardo Folcaut gotzainak ediktu batean adierazten du San Migel Kofradiak zenbat kofrade dituen. Kofrade horiek 40.000 dira, eta 20 kleriko dituzte beren zerbitzura.
1620. Lapurreta zapuztua santutegian. Lapurtzera sartzen diren hiru lapur geldirik geratzen dira eliza barruan, eta harrapatuak izaten dira.
1687. Manuel Gonzalezek eta Juan de Jauregik irudia lapurtzea. Bata urkatua izan zen, eta bestea biziarteko kartzelara kondenatua.
1756. San Migelen irudia, egurrez landua, gaur egun ezagutzen dugun zilarrezko kaxa sobredoratuan kokatzen da, goiko aldean XI. mendearen amaieratik santutegiak duen Lignum Crucis ontziaren zatia jarriz.
1765. Aralarko erretaula esmaltatua, XII. mendearen amaieran egin zenetik, barneko kaperaren aldarearen aurrealdean, Iruñera eraman zuten, garbitu eta berregiteko. Ondoren, santutegiko aldare nagusian jarri zuten.
1797. Zazpi ikazkin euskaldunek santutegian egindako lapurreta. Zerbitzariak lotu eta ahal zuten guztia lapurtu zuten, San Migelen irudia barne, hiru puskatan puskatu baitzuten. Atxilotu egin zituzten, eta horietako hiru urkamendian egokitu zituzten, Iruñean.
1799. Katedraleko Musika Kapera santutegian aritzen da kofradien egunean, abuztuan egiten zen ohiko kontzentrazioa, Jasokundearen ondorengo igandean (hilaren 15ean).
1865. Pedro de Madrazo eta Kuntz antzinako artistetan adituak santutegia bisitatu eta esmaltezko erretaula miresten du. Bere berri ematen du bi argitalpenetan eta bitxi honen existentzia zabaltzen du zirkulu artistiko eta historikoetan, beraz, ordutik aurrera Erdi Aroko urregintzako maisulan bezala baloratua izaten hasten da.
1884. Alfontso XII.a Espainiako erregea, Beteluko bainuetxean urak hartzen ari zena, Lekunberritik santutegira igotzen da, abuztuaren 2an, Vicente Astiz Lekunberriko bizilagunak eskainitako zalditegi batean. Gerrako Ministroa, General Quesada, bere laguntzailea Sextoko dukea eta bere familia-medikua, kamisoi doktorea.
1889. Iruñeko Elizbarrutiak antolatutako erromesaldi handi bat, hiriburuko eta beste herri batzuetako 15.000 fededunek baino gehiagok osatua, ekainaren 3an santutegiraino iritsiko da, kristauek Espainian izan zuten presentziaren XIII. mendeurrena ospatzeko.
1899. Abuztuaren 25ean, bigarren erromesaldi handi batek, XIX. mendearen amaiera ospatzeko, Aralarko santutegia du eszenatoki. 20.000 pertsona inguru biltzen dira. Guztira, Barranca, Larraun eta Araiz inguruko haranetatik etorritako 47 parrokia-gurutze biltzen dira ospakizunetan.
1902. Abuztuaren 18an, Espainiako errege Alfontso XIII.ak santutegia bisitatu zuen. Uharte Arakiletik oinez igotzen da.
1909. Irailean, santutegira igo zen Miguel de Unamuno idazle eta pentsalaria, bere “por tierras de Portugal y de España” lanean jasotako artikulu batean bere esperientzia kontatzen duena.
1925. Aparatu elektrogeno baten bidez, argi elektrikoa iristen da Aralarko santutegira, ondoren linea finko baten trazaduraren bidez aseguratua. Aurten ere lehen telefonoa jarri dute santutegian.
1931. Aralarko santutegia, ekainaren 4an, Espainiako altxor artistiko nazionalaren monumentu historiko-artistiko izendatu zuten, Espainiako Errepublikako Instrukzio Publiko eta Arte Ederretako Ministerioaren dekretu bidez.
1936. Lehen automobila santutegira iritsi zen. Urtarrilaren 12an, Oruga auto batek, SS 7945 matrikulak, errepiderik ez izatearen zailtasuna gainditu zuen eta bide osoa egin zuen santutegira iritsi arte.
1942. Sute izugarri batek erabat suntsitzen du santutegiko ostatua. Santutegiko biztanleen eta Uharte Arakil eta beste herri batzuetako bizilagunen jarduera arduratsua, foruak tenpluari eragiten diona.
1965. Irailean, Baso Etxetik santutegira sartzeko errepidea inauguratu zen (Bustingorrieta). Baraibaretik puntu horretarainoko sarbidea, Larraun bailaran, 1949an eraiki zen.
1966. Nafarroako Foru Aldundiak Santutegiko ostatu berria eraikitzea erabaki zuen, ostatu, taberna eta aterpe gune irekiekin. Jose Luis Cia arkitektoari eman diote proiektuaren ardura, Julian Arteagaren laguntzarekin. Lanak 1968an hasi eta 1972ko irailean bukatuko dituzte.
1972. Nafarroako Foru Aldundiko Vianako Printzea Erakundeak, Francisco Iñiguez Almechen zuzendaritzapean, monumentuaren zaharberritze orokorrari ekiten dio, zinborio oktogonala berreraikitzea barne hartzen duena.
1979. “Erik belgikarra” nazioarteko gaizkileak zuzendutako lapur talde batek esmaltezko erretaulatik pieza guztiak atera eta lapurtzen ditu.
1981. Interpolen bidez Aralarko esmalteen ezaugarri zehatzak dituen dosier bat zabaldu ondoren, hauek agertzen dira hainbat kokapenetan: Parisen, Erroman eta Ganten.
1982. Uharte Arakil zuzenean santutegiarekin lotzen duen errepidea ireki zuten.
1991. Maiatzaren 20an berriro jarri zuten santutegian, beharrezko segurtasun neurriekin, Aralarko esmalteen aurrealdea.
1996. Abenduaren 30ean, Nafarroako Gobernuak, foru dekretu bidez, interes kulturaleko ondasun izendatu zuen Aralarko San Migel santutegiko esmalte erromanikoen aurrealdea, Europako Erdi Aroko esmalteriako obra garrantzitsuenetako bat delako.
1997. Nafarroako Gobernuak monumentuaren azken zaharberritzea egiten du, teilatua bustiz, gainjantzia hondakinez garbituz eta lurraren azpian berogailua jarriz. Lan horiek 10 hilabete irauten dute eta Javier Sancho arkitektoak zuzentzen ditu.
2001. Inocencio Ayerbe jauna hil zen, 1945etik santutegiko kapilaua.
2002. Ostatua birmoldatzeko lanak hasi ziren, jatetxe eta kafetegi gisa erabiltzeko.
